Jan Warkentin var uddannet journalist og arbejdede i en årrække for forskellige dagblade, blandt andre Berlingske.

Fra 1986 stod han som stationschef i spidsen for Radio HSR (Hovedstadens Socialdemokratiske Radio) og et par år senere skiftede han til lokal-tv, hvor han blev programchef for HTV, skriver TvNyt. 

Fagbevægelsen trak sig delvist ud af lokal tv/radio i slutfirserne, men Jan Warkentin blev ombord for at være del af den forestående kommercielle professionalisering af den storkøbenhavnske Kanal2

I 1990 blev han udnævnt til personale- og produktionsdirektør på Kanal 2, der samtidig blev hovedkanalen i det nyetablerede SBS broadcasting.

Kanal 2 blev i 1997 grundpillen i det nye landsdækkende tv-network 'TvDanmark', der gennem årene udfoldede sig til de mange SBS-kanaler, der findes i dag.

Godt ti år senere blev Jan Warkentin i 1999 informationskonsulent og senere administrationschef for Red Barnet.